Предложения со словосочетанием «скорость мутаций»
Она не сопоставима со скоростью мутации вируса гриппа, который в этом плане просто чемпион.
В каждом маркере скорость мутации в среднем в 25 раз медленнее, то есть раз в 550 поколений, или примерно раз в 14 тысяч лет.
Понятно, что интенсивность эволюционных преобразований сильно зависит от жёсткости условий, темпов природных изменений, скорости мутаций и длины поколения.
Константа скорости мутации – 0,046 мутаций на гаплотип на условное поколение в 25 лет.
Скорость мутаций вполне предсказуема, и её можно сверить с имеющимися фоссилиями, чтобы определить, когда два вида произошли от общего предка.
Привет! Меня зовут Лампобот, я компьютерная программа, которая помогает делать
Карту слов. Я отлично
умею считать, но пока плохо понимаю, как устроен ваш мир. Помоги мне разобраться!
Спасибо! Я стал чуточку лучше понимать мир эмоций.
Вопрос: геликоид — это что-то нейтральное, положительное или отрицательное?
Нейтральное
Положительное
Отрицательное
Не знаю
Во всяком случае, со времён общего предка нас и шимпанзе средняя скорость мутации оставалась одинаковой.
Поскольку средняя скорость мутаций, а это и есть ошибки копирования, определена и известна: в 111-маркерном гаплотипе – это в среднем раз в 125 лет.
И вот после рассмотрения тысяч гаплотипов и сопоставления результатов с документальными генеалогиями (для которых времена известны, а ошибки можно отфильтровать при массовых сопоставлениях), а также с известными историческими событиями, было найдено, что скорость мутаций в среднем одинакова для каждого 25-маркерного гаплотипа, независимо от того, какой он гаплогруппы, когда жил общий предок, где на планете он жил и в какое время.
Но удобнее считать в скоростях мутаций на гаплотип в целом.
Нужно разделить общее число гаплотипов в серии (10) на число базовых гаплотипов (5), взять натуральный логарифм, и разделить всё это на константу скорости мутации.
Если разделить на число маркеров в каждом случае, то средняя скорость мутации на маркер равна 0,00184, 0,00243, 0,00179 и 0,00178 мутаций на поколение, то есть – опять же в среднем – примерно 0,002 мутации на поколение, или одна мутация на маркер происходит примерно раз в 500 лет.
Поскольку средняя скорость мутаций (это и есть ошибки копирования) определена и известна (в 111-маркерном гаплотипе это в среднем раз в 125 лет), то по совокупности гаплотипов членов одного рода можно рассчитать, когда жил их общий предок.
Даже если скорость мутаций не такая точная, а, как свидетельствуют разные публикации, между 0.5 и 1.0 × 10-9, то снип-мутации происходят в среднем между 0.725 и 1.45 мутаций на всю Y-хромосому за 25 лет.
Если взять 25 лет на поколение для одной константы скорости мутации, 30 лет – для другой константы, 20 лет на поколение для ещё одной константы, но конечный результат получается один и тот же.
Чем короче гаплотип, тем реальная скорость мутации более отклоняется от средней величины.
Здесь 0.0074 мутаций на гаплотип – контанта скорости мутации для 6-маркерных гаплотипов, стрелка – табличная поправка на возвратные мутации.
Во-первых, эта скорость мутации, раз в 14 тысяч лет – средняя величина, рассчитанная по большому числу маркеров.
Здесь 0.02 и 0.046 – константы скорости мутаций для 12- и 25-маркерных гаплотипов.
Мы уже видим, что если скорость мутации не откалибровать надёжно, то точность такого метода невелика.
Качественная суть этих уравнений в том, что при одинаковой скорости мутаций в популяции большего эффективного размера отбор более интенсивный.
Здесь 0.02 мутаций на гаплотип – контанта скорости мутаций для 12-маркерных гаплотипов.
Поэтому протяжённость поколения нельзя брать произвольно, как захотим, она завязана на константу скорости мутации.
Заметим, что чем длиннее гаплотип, тем более стабилизуется константа скорости мутации в расчёте на маркер.
Используя эту константу скорости мутаций можно рассчитывать, сколько времени потребуется для прохождения определённого количества мутаций во фрагменте Y-хромосомы определённого размера.
Таким образом, молекулярные часы означают, что количество мутаций на любом ребре пропорционально прошедшему времени, при этом константа пропорциональности представляет собой постоянную скорость мутации.
Если обозначает скорость мутации, измеряемую, например, в количестве произошедших за год замен оснований на сайт, а обозначает время в годах, то количество мутаций, которое произойдёт в течение этого времени, составляет базовых замен на сайт.
Без получения какой-либо дополнительной информации о скорости мутации – возможно, путём сравнения с летописью окаменелостей – обычно нет способов определения прошедшего времени, связанного с рёбрами деревьев.
Для 67-маркерных гаплотипов она равна 0.12/67 = 0.00179 мутаций на маркер, для 111-маркерных гаплотипов она равна 0.198/111 = 0.00178 мутаций на маркер, и если для 409 маркерных гаплотипов она тоже равна 0.00178 мутаций на маркер, то скорость мутаций равна 0.00178x409 = 0.728 мутаций на весь гаплотип.
Число этих мутаций связано с временем, прошедшим от общего предка, с числом гаплотипов в серии, и с константой скорости мутации в гаплотипах, и выражается простой формулой: n/N = kt, где n – число мутаций в серии из N гаплотипов, k – константа скорости мутации (в числе мутаций на гаплотип за условное поколение, равное 25 лет), t – число условных поколений, с табличной поправкой на возвратные мутации.
Судя по палеонтологической летописи и по измерениям скорости мутаций, представители этой концепции считают, что полная несовместимость геномов, делающая невозможным скрещивание, достигается в природе в среднем на протяжении 3 млн лет.
Однако при очень больших временах, более 10–20 тысяч лет, и особенно более 100 тысяч лет, нужно использовать гаплотипы с «медленными» маркерами, то есть с малыми константами скоростей мутаций, и тем самым снижать число мутаций и число возвратных мутаций.
Однако высокая скорость мутаций может сделать вакцинацию от коронавируса бесполезной. И, в случае заболевания, вам вновь понадобится постковидная реабилитация.
В настоящее время рассматривается несколько гипотез, помогающих сделать поправки и увязать данные между собой: расчёты, производимые на основе неполных данных о семействах, не позволяют выявить все мутации и приводят к их недооценке, давая слишком медленные молекулярные часы; молекулярные часы идут не с постоянной скоростью: порой они ускоряются – в частности, у людей их скорость зависит от репродуктивного возраста, который менялся в ходе эволюции приматов; наконец, скорость мутаций может варьироваться в разных частях генома и оставаться постоянной лишь для определённых его участков.
Но это не так, поэтому и отмечается большой временной разброс в скоростях мутаций у различных нардов.
Напомним, что молекулярные часы просто означают, что скорость мутаций постоянна для всех рассматриваемых линий.
Время жизни общего предка популяции вычисляется по совокупности гаплотипов его потомков, принимая во внимание число мутаций, накопившееся в популяции, нормированное на гаплотип или на маркер, и константу скорости мутации, или частоту мутации в расчёте на поколение.
Наконец, исследователи в компании YFull, которые занимаются расчётами скоростей мутаций в Y-хромосоме, принимают в своих расчётах величину скорости 0.8178 × 10-9 на нуклеотид за год, хотя такая точность определения совершенно нереальна.
Это означает, что каждому маркеру свойственна определённая константа скорости мутации, и каждому гаплотипу (состоящему, как мы уже знаем, из набора маркеров) – тоже свойственна определённая средняя константа скорости мутации, равная сумме констант скоростей мутаций отдельных маркеров.
На первый вопрос (происхождение) призвано ответить дерево снипов, на второй (время появления) – скорость мутации.
Число этих мутаций связано с временем, прошедшим от общего предка, с числом гаплотипов в серии, и с константой скорости мутации в гаплотипах, и выражается простой формулой: n/N = kt, где и – число мутаций в серии из N гаплотипов, к – константа скорости мутации (в числе мутаций на гаплотип за условное поколение, равное 25 лет), t – число условных поколений, с табличной поправкой на возвратные мутации.
Поскольку вероятностные мутации, как правило, протекают очень медленно и имеют высокую вероятность неудачи, вероятностные мутации могут быть полезны только для систем, которые могут подвергаться очень высокой скорости мутации.
Первой статьёй в «Успехах антропологии» была статья по константам скоростей мутаций в гаплотипах Y-хромосомы и их калибровке, то есть количественной связи с хронологией.
Можно подсчитать, что эти гаплотипы разошлись на 26 мутаций, и расчёты, основанные на скорости мутации каждого маркёра, показывают, что эти 26 мутаций соответствуют времени жизни их общего предка примерно 210 тысяч лет назад.
Ассоциации к слову «скорость»
Синонимы к слову «мутация»
Сочетаемость слова «скорость»
- на полной скорости
с бешеной скоростью
с огромной скоростью - скорость света
скорость движения
скорость передвижения - превышение скорости
увеличение скорости
переключение скоростей - скорость увеличилась
скорость упала
скорость возросла - набирать скорость
сбавить скорость
снизить скорость - (полная таблица сочетаемости)
Сочетаемость слова «мутация»
Значение слова «скорость»
СКО́РОСТЬ, -и, род. мн. -е́й, ж. 1. Степень быстроты движения кого-, чего-л. или распространения чего-л. Скорость полета. Скорость бега. Скорость течения. Скорость света. Скорость звука. (Малый академический словарь, МАС)
Значение слова «мутация»
МУТА́ЦИЯ, -и, ж. 1. Всякое скачкообразное изменение чего-л. (Малый академический словарь, МАС)
Афоризмы русских писателей со словом «скорость»
- Из совокупности
Избытков скоростей,
Машин и жадности
Возникло государство. - От скорости века в сонности
Живем мы, в живых не значась…
Непротивление совести —
Удобнейшее из чудачеств! - Труд рабочего,
хлеб крестьян —
на этих
двух осях
катится
время
на всех скоростях,
и вертится
жизнь вся. - (все афоризмы русских писателей)
Отправить комментарий
Значение слова «скорость»
СКО́РОСТЬ, -и, род. мн. -е́й, ж. 1. Степень быстроты движения кого-, чего-л. или распространения чего-л. Скорость полета. Скорость бега. Скорость течения. Скорость света. Скорость звука.
Все значения слова «скорость»Значение слова «мутация»
МУТА́ЦИЯ, -и, ж. 1. Всякое скачкообразное изменение чего-л.
Все значения слова «мутация»