Предложения со словом «гаплотип»
Допустим, среди этого десятка 25-маркерных гаплотипов пять одинаковые, а в остальных пяти есть суммарно 7 мутаций от этих пяти одинаковых.
Возможно, их и не осталось, одна надежда на ископаемые гаплотипы, но их пока проанализированы единицы.
Вершина внизу – это гаплотип общего предка рода, от него пирамида расходится.
Суть такова, что чем больше мутаций в гаплотипах группы людей – тем древнее их общий предок.
Если бы пирамида была идеальной – трёх точек, то есть трёх гаплотипов в основании было бы достаточно, чтобы рассчитать расстояние до вершины.
Привет! Меня зовут Лампобот, я компьютерная программа, которая помогает делать
Карту слов. Я отлично
умею считать, но пока плохо понимаю, как устроен ваш мир. Помоги мне разобраться!
Спасибо! Я стал чуточку лучше понимать мир эмоций.
Вопрос: пиридоксин — это что-то нейтральное, положительное или отрицательное?
Нейтральное
Положительное
Отрицательное
Не знаю
Иначе говоря, каждый из нас имеет свои индивидуальные мутации, но гаплотип предка на всех один.
Так просто получилось, что у этих пяти так и остался предковый гаплотип, без изменений, но у их потомков рано или поздно мутирует.
Это цифра – вполне надёжная, она проверена перекрёстным расчётом по гаплотипам разной длины.
Когда эти два метода расчётов дают совпадающие результаты, это означает, что расчёты принципиально верные, и что у данного набора гаплотипов был действительно один общий предок.
Очень похожи на славянские гаплотипы R1a, приведённые выше, на первых 12 маркерах, особенно если учесть, что эти древние несут ещё и индивидуальные, случайные мутации.
Со времени жизни общего предка до настоящего времени в десяти 25-маркерных гаплотипах произошло 7 мутаций.
Степень сходства между всеми четырьмя гаплотипами видна сразу.
Оно не отражает историю миграций популяции, и тем более историю гаплогруппы I2 до их катастрофы около 5 тысяч лет назад, как показывает анализ гаплотипов.
Базовый гаплотип башкирских Z140 отличается от общеевропейского I1 на 14 мутаций (в 67-маркерном формате), что и помещает их общего предка с европейскими I1 на те же 3600 лет, то есть к самим европейским выжившим I1.
Именно так гаплогруппа определяет носителя гаплотипа в определённый род или историческое племя.
Дерево гаплотипов – это пирамида, стоящая на вершине.
Таким образом, по совокупности гаплотипов членов одного рода можно рассчитать, – когда жил их общий предок.
Это – ареал самых древних европейских гаплотипов рода R1a.
Потому этот гаплотип можно назвать индивидуальным «паспортом» каждого человека.
Это соответствует разнице в тысячу триста поколений, то есть общий предок этих двух (ныне) славянских гаплотипов жил более 20 тысяч лет назад.
Он имеет 28 мутаций на 25 маркерах по сравнению с приведённым выше 25-маркерным гаплотипом R1a (надо отметить, что некоторые мутации считаются по-особому, но на этом сейчас останавливаться не будем).
Здесь между двумя гаплотипами уже три мутации, что даёт 3/0.02 = 150 → 176 условных поколений, или 4400 лет, то есть общий предок жил примерно 2200 лет назад.
Естественно, чем протяжённее гаплотип, тем выше вероятность того, что в нём произойдёт мутация.
Но даже отсюда можно – просто на взгляд, без расчётов – получить граничную информацию о времени жизни общего предка серии гаплотипов, в данном случае – больше 2100 лет назад.
Длинные гаплотипы определяют в коммерческих компаниях, обычно персонально, каждый для себя, и передают, как правило, в общественные базы данных.
Все упомянутые пары и тройки однонулей в каждом субкладе имеют одинаковые или почти одинаковые гаплотипы, что означает, что они близкие родственники друг другу.
Но их определять дороже, чем более короткие, поэтому в академических исследованиях, при постоянной нехватке денежных средств, приходится работать с более короткими гаплотипами.
Надо отметить, что 6-маркерные гаплотипы весьма неточны, для показа чего и служит этот иллюстративный пример.
Но часто бывает, что другие методы непригодны, или нет соответствующих гаплотипов.
Что важно отметить – в большинстве случаев результаты расчётов почти не зависят от размера выборки (при числе гаплотипов больше двух-трёх десятков), то есть они достаточно устойчивы к статистическим вариациям.
Рис. 1. Дерево из 67 гаплотипов современных немцев гаплогруппы R1a в 25-маркерном формате (Клёсов, 2008).
Расчёт по мутациям (для 67-маркерных гаплотипов) даёт 4325±350 лет до общего предка.
Поэтому есть ещё одно условие, точнее, следствие – мутации в гаплотипах потомков при экстраполяции в прошлое сходятся к «первопредку».
Гаплогруппа – группа схожих гаплотипов, имеющих общего предка, у которого произошла мутация, унаследованная всеми потомками (обычно – однонуклеотидный полиморфизм).
Первой статьёй в «Успехах антропологии» была статья по константам скоростей мутаций в гаплотипах Y-хромосомы и их калибровке, то есть количественной связи с хронологией.
Анализ мтДНК выявил 28 митохондриальных гаплотипов, принадлежавших к 11 гаплогруппам, как западноевразийским (H, J, T, U, X), так и восточноевразийским (A, B, C, D, F, G).
Отображают картину мутаций в виде так называемых гаплотипов, упомянутых выше как «личный номер паспорта» каждого мужчины, а именно в виде определённых последовательностей чисел, характерных для каждого человека.
Однако при очень больших временах, более 10–20 тысяч лет, и особенно более 100 тысяч лет, нужно использовать гаплотипы с «медленными» маркерами, то есть с малыми константами скоростей мутаций, и тем самым снижать число мутаций и число возвратных мутаций.
Сказать это с большей определённостью можно тогда, когда подсчитано число мутаций во всех ста гаплотипах, и если оно будет равно, например, 324 (или близко к тому), тогда 324/100/0.09 = 36 → 37 условных поколений (этот метод расчёта называется линейным, в отличие от приведённого выше логарифмического), то есть ровно тот же промежуток времени до общего предка.
Вариация датировок по первым трём форматам гаплотипов уже заметна, и достигает 55 % (1950, 2200, и 3025).
Все R1a1a гаплотипы принадлежат субкладу R1a1a1b2, азиатской ветви гаплогруппы R1a1a, возникшей в евразийских степях.
И время жизни первопредка, на которое указывают самые древние, самые мутированные гаплотипы – это 7,5 тысяч лет назад.
Правда, у модального гаплотипа была одна проблема.
Примечательно, что коэнский гаплотип напрочь отсутствует у нееврейского населения стран с большими еврейскими диаспорами.
Гаплогруппы же и гаплотипы никак не определяют форму черепа или носа, цвет волос или глаз, физические или умственные характеристики человека.
Поэтому будем использовать в этом рассказе 25-маркерные гаплотипы.
В последующей главе настоящей книги про гаплотипы славян и индусов я пишу, что у них, славян и индусов, оказался один и тот же общий предок.
Поскольку у всех прочих европейцев рода R1a гаплотип первопредка на соответствующих территориях такой же, то не буду это больше и упоминать.
Они обычно ограничиваются 8-, 10-, или 17-маркерными гаплотипами.
Совпадение подобных гаплотипов у двух людей, не связанных близким родством, крайне маловероятно.
Сочетаемость слова «гаплотип»
Значение слова «гаплотип»
Гаплотип (сокр. от «гаплоидный генотип») — совокупность аллелей на локусах одной хромосомы, обычно наследуемых вместе. Если же при кроссинговере комбинация аллелей меняется (что происходит очень редко), говорят о возникновении нового гаплотипа. Гаплотип может быть как у одного локуса, так и у целого генома. Генотип определенных генов диплоидной особи состоит из двух гаплотипов, расположенных на двух хромосомах, полученных от матери и отца соответственно. (Википедия)
Цитаты со словом «гаплотип»
- Сравнительно тёмная окраска и мезокефалия были свойственны также древнему и средневековому населению Северного Причерноморья (С.14)
- Население отдельных областей Западной Европы по антропологическим признакам (и другим особенностям) различается друг от друга значительно более, чем отдельные русские группы (С.132)
- Верхнеокский тип не может быть включен в балтийскую серию вариантов и не имеет признаков влияния какой-либо уральской группы (С.171)
- (все цитаты)
Отправить комментарий
Дополнительно
Значение слова «гаплотип»
Гаплотип (сокр. от «гаплоидный генотип») — совокупность аллелей на локусах одной хромосомы, обычно наследуемых вместе. Если же при кроссинговере комбинация аллелей меняется (что происходит очень редко), говорят о возникновении нового гаплотипа. Гаплотип может быть как у одного локуса, так и у целого генома. Генотип определенных генов диплоидной особи состоит из двух гаплотипов, расположенных на двух хромосомах, полученных от матери и отца соответственно.
Все значения слова «гаплотип»