Транскриптомика одиночных клеток

Транскриптомика отдельных клеток (англ. single-cell transcriptomics) — область биологических исследований, в которой основным инструментом служат методы количественного анализа экспрессии генов в индивидуальных клетках. Эти методы сочетают в себе современные технологии секвенирования РНК отдельных клеток (scRNA-Seq от англ. single-cell RNA sequencing) и последние достижения микрогидродинамики. Они позволяют решить проблему «усреднённых» данных, получаемых при традиционном секвенировании массовых популяций клеток.

Одноклеточное секвенирование РНК сделало возможными анализ клеточного многообразия в популяциях клеток, считавшихся ранее однородными; анализ траекторий развития клеток и моделирование динамики транскрипционных процессов — и всё это в очень высоком биологическом «разрешении», недостижимом при секвенировании ансамблей клеток. Из-за этого сильно возрастает размерность данных и, как следствие, вычислительная сложность анализа. Кроме того, несмотря на стремительное развитие, методы одноклеточного секвенирования всё ещё имеют определённые технические недостатки. В последние годы продолжают разрабатываться всё новые и новые биоинформатические методы для преодоления указанных проблем и получения более точных результатов экспериментов с отдельными клетками.

С помощью технологий одноклеточное секвенирования РНК и методов транскриптомики уже получены важные результаты в иммунологических, эмбриологических и онкологических исследованиях.

Источник: Википедия